Personal tools
You are here: Home / Example files / Nomenclature of the atom names

Nomenclature of the atom names

src/py/data/atomnames.xml from the ARIA distribution

Extensible Markup Language (XML) icon atomnames.xml — Extensible Markup Language (XML), 45 KB (46951 bytes)

File contents

<!--

Authors: Michael Habeck
         Wolfgang Rieping
         Institut Pasteur, Paris
        
         Copyright (C) 2003 Michael Habeck and Wolfgang Rieping
         No warranty implied or expressed.
         All rights reserved.

$Author: rieping $
$Revision: 1.2 $
$Date: 2003/03/06 14:08:33 $

-->

<conversion_table>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="ALA" cns_name="ALA" dyana_name="ALA">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB1" cns_name="HB2" dyana_name="HB1"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB1" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB3" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="ARG" cns_name="ARG" dyana_name="ARG">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD" cns_name="CD" dyana_name="CD"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="CZ" cns_name="CZ" dyana_name="CZ"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HD3" cns_name="HD1" dyana_name="HD3"/>
    <atom iupac_name="HE" cns_name="HE" dyana_name="HE"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HH11" cns_name="HH12" dyana_name="HH11"/>
    <atom iupac_name="HH12" cns_name="HH11" dyana_name="HH12"/>
    <atom iupac_name="HH21" cns_name="HH22" dyana_name="HH21"/>
    <atom iupac_name="HH22" cns_name="HH21" dyana_name="HH22"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NE" cns_name="NE" dyana_name="NE"/>
    <atom iupac_name="NH1" cns_name="NH1" dyana_name="NH1"/>
    <atom iupac_name="NH2" cns_name="NH2" dyana_name="NH2"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="ASN" cns_name="ASN" dyana_name="ASN">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD21" cns_name="HD21" dyana_name="HD21"/>
    <atom iupac_name="HD22" cns_name="HD22" dyana_name="HD22"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="ND2" cns_name="ND2" dyana_name="ND2"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OD1" cns_name="OD1" dyana_name="OD1"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="ASP" cns_name="ASP" dyana_name="ASP">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OD1" cns_name="OD1" dyana_name="OD1"/>
    <atom iupac_name="OD2" cns_name="OD2" dyana_name="OD2"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="CYS" cns_name="CYS" dyana_name="CYS">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HG" cns_name="HG" dyana_name="HG"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="SG" cns_name="SG" dyana_name="SG"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="GLN" cns_name="GLN" dyana_name="GLN">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD" cns_name="CD" dyana_name="CD"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HE21" cns_name="HE21" dyana_name="HE21"/>
    <atom iupac_name="HE22" cns_name="HE22" dyana_name="HE22"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NE2" cns_name="NE2" dyana_name="NE2"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OE1" cns_name="OE1" dyana_name="OE1"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="GLU" cns_name="GLU" dyana_name="GLU">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD" cns_name="CD" dyana_name="CD"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OE1" cns_name="OE1" dyana_name="OE1"/>
    <atom iupac_name="OE2" cns_name="OE2" dyana_name="OE2"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="GLY" cns_name="GLY" dyana_name="GLY">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA2" cns_name="HA1" dyana_name="HA2"/>
    <atom iupac_name="HA3" cns_name="HA2" dyana_name="HA1"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="HIS" cns_name="HIS" dyana_name="HIS">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD2" cns_name="CD2" dyana_name="CD2"/>
    <atom iupac_name="CE1" cns_name="CE1" dyana_name="CE1"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD1" cns_name="HD1" dyana_name="HD1"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HE1" cns_name="HE1" dyana_name="HE1"/>
    <atom iupac_name="HE2" cns_name="HE2" dyana_name="HE2"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="ND1" cns_name="ND1" dyana_name="ND1"/>
    <atom iupac_name="NE2" cns_name="NE2" dyana_name="NE2"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="ILE" cns_name="ILE" dyana_name="ILE">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD1" cns_name="CD1" dyana_name="CD1"/>
    <atom iupac_name="CG1" cns_name="CG1" dyana_name="CG1"/>
    <atom iupac_name="CG2" cns_name="CG2" dyana_name="CG2"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB" cns_name="HB" dyana_name="HB"/>
    <atom iupac_name="HD11" cns_name="HD12" dyana_name="HD11"/>
    <atom iupac_name="HD12" cns_name="HD11" dyana_name="HD12"/>
    <atom iupac_name="HD13" cns_name="HD13" dyana_name="HD13"/>
    <atom iupac_name="HG12" cns_name="HG12" dyana_name="HG12"/>
    <atom iupac_name="HG13" cns_name="HG11" dyana_name="HG13"/>
    <atom iupac_name="HG21" cns_name="HG22" dyana_name="HG21"/>
    <atom iupac_name="HG22" cns_name="HG21" dyana_name="HG22"/>
    <atom iupac_name="HG23" cns_name="HG23" dyana_name="HG23"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="LEU" cns_name="LEU" dyana_name="LEU">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD1" cns_name="CD1" dyana_name="CD1"/>
    <atom iupac_name="CD2" cns_name="CD2" dyana_name="CD2"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD11" cns_name="HD12" dyana_name="HD11"/>
    <atom iupac_name="HD12" cns_name="HD11" dyana_name="HD12"/>
    <atom iupac_name="HD13" cns_name="HD13" dyana_name="HD13"/>
    <atom iupac_name="HD21" cns_name="HD22" dyana_name="HD21"/>
    <atom iupac_name="HD22" cns_name="HD21" dyana_name="HD22"/>
    <atom iupac_name="HD23" cns_name="HD23" dyana_name="HD23"/>
    <atom iupac_name="HG" cns_name="HG" dyana_name="HG"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="LYS" cns_name="LYS" dyana_name="LYS">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD" cns_name="CD" dyana_name="CD"/>
    <atom iupac_name="CE" cns_name="CE" dyana_name="CE"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HD3" cns_name="HD1" dyana_name="HD3"/>
    <atom iupac_name="HE2" cns_name="HE2" dyana_name="HE2"/>
    <atom iupac_name="HE3" cns_name="HE1" dyana_name="HE3"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="HZ1" cns_name="HZ2" dyana_name="HZ1"/>
    <atom iupac_name="HZ2" cns_name="HZ1" dyana_name="HZ2"/>
    <atom iupac_name="HZ3" cns_name="HZ3" dyana_name="HZ3"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="NZ" cns_name="NZ" dyana_name="NZ"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="MET" cns_name="MET" dyana_name="MET">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CE" cns_name="CE" dyana_name="CE"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HE1" cns_name="HE2" dyana_name="HE1"/>
    <atom iupac_name="HE2" cns_name="HE1" dyana_name="HE2"/>
    <atom iupac_name="HE3" cns_name="HE3" dyana_name="HE3"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="SD" cns_name="SD" dyana_name="SD"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="PHE" cns_name="PHE" dyana_name="PHE">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD1" cns_name="CD1" dyana_name="CD1"/>
    <atom iupac_name="CD2" cns_name="CD2" dyana_name="CD2"/>
    <atom iupac_name="CE1" cns_name="CE1" dyana_name="CE1"/>
    <atom iupac_name="CE2" cns_name="CE2" dyana_name="CE2"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="CZ" cns_name="CZ" dyana_name="CZ"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD1" cns_name="HD1" dyana_name="HD1"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HE1" cns_name="HE1" dyana_name="HE1"/>
    <atom iupac_name="HE2" cns_name="HE2" dyana_name="HE2"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="HZ" cns_name="HZ" dyana_name="HZ"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="PRO" cns_name="PRO" dyana_name="PRO">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD" cns_name="CD" dyana_name="CD"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HD3" cns_name="HD1" dyana_name="HD3"/>
    <atom iupac_name="HG2" cns_name="HG2" dyana_name="HG2"/>
    <atom iupac_name="HG3" cns_name="HG1" dyana_name="HG3"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="SER" cns_name="SER" dyana_name="SER">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HG" cns_name="HG" dyana_name="HG"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OG" cns_name="OG" dyana_name="OG"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="THR" cns_name="THR" dyana_name="THR">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CG2" cns_name="CG2" dyana_name="CG2"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB" cns_name="HB" dyana_name="HB"/>
    <atom iupac_name="HG1" cns_name="HG1" dyana_name="HG1"/>
    <atom iupac_name="HG21" cns_name="HG21" dyana_name="HG21"/>
    <atom iupac_name="HG22" cns_name="HG22" dyana_name="HG22"/>
    <atom iupac_name="HG23" cns_name="HG23" dyana_name="HG23"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OG1" cns_name="OG1" dyana_name="OG1"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="TRP" cns_name="TRP" dyana_name="TRP">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD1" cns_name="CD1" dyana_name="CD1"/>
    <atom iupac_name="CD2" cns_name="CD2" dyana_name="CD2"/>
    <atom iupac_name="CE2" cns_name="CE2" dyana_name="CE2"/>
    <atom iupac_name="CE3" cns_name="CE3" dyana_name="CE3"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="CH2" cns_name="CH2" dyana_name="CH2"/>
    <atom iupac_name="CZ2" cns_name="CZ2" dyana_name="CZ2"/>
    <atom iupac_name="CZ3" cns_name="CZ3" dyana_name="CZ3"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD1" cns_name="HD1" dyana_name="HD1"/>
    <atom iupac_name="HE1" cns_name="HE1" dyana_name="HE1"/>
    <atom iupac_name="HE3" cns_name="HE3" dyana_name="HE3"/>
    <atom iupac_name="HH2" cns_name="HH2" dyana_name="HH2"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="HZ2" cns_name="HZ2" dyana_name="HZ2"/>
    <atom iupac_name="HZ3" cns_name="HZ3" dyana_name="HZ3"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NE1" cns_name="NE1" dyana_name="NE1"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="TYR" cns_name="TYR" dyana_name="TYR">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CD1" cns_name="CD1" dyana_name="CD1"/>
    <atom iupac_name="CD2" cns_name="CD2" dyana_name="CD2"/>
    <atom iupac_name="CE1" cns_name="CE1" dyana_name="CE1"/>
    <atom iupac_name="CE2" cns_name="CE2" dyana_name="CE2"/>
    <atom iupac_name="CG" cns_name="CG" dyana_name="CG"/>
    <atom iupac_name="CZ" cns_name="CZ" dyana_name="CZ"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB2" cns_name="HB2" dyana_name="HB2"/>
    <atom iupac_name="HB3" cns_name="HB1" dyana_name="HB3"/>
    <atom iupac_name="HD1" cns_name="HD1" dyana_name="HD1"/>
    <atom iupac_name="HD2" cns_name="HD2" dyana_name="HD2"/>
    <atom iupac_name="HE1" cns_name="HE1" dyana_name="HE1"/>
    <atom iupac_name="HE2" cns_name="HE2" dyana_name="HE2"/>
    <atom iupac_name="HH" cns_name="HH" dyana_name="HH"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
    <atom iupac_name="OH" cns_name="OH" dyana_name="OH"/>
  </residue>
  <residue residue_type="AMINO_ACID" iupac_name="VAL" cns_name="VAL" dyana_name="VAL">
    <atom iupac_name="C" cns_name="C" dyana_name="C"/>
    <atom iupac_name="CA" cns_name="CA" dyana_name="CA"/>
    <atom iupac_name="CB" cns_name="CB" dyana_name="CB"/>
    <atom iupac_name="CG1" cns_name="CG1" dyana_name="CG1"/>
    <atom iupac_name="CG2" cns_name="CG2" dyana_name="CG2"/>
    <atom iupac_name="H" cns_name="HN" dyana_name="HN"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="HT3" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="HT2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="HT1" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="HA" cns_name="HA" dyana_name="HA"/>
    <atom iupac_name="HB" cns_name="HB" dyana_name="HB"/>
    <atom iupac_name="HG11" cns_name="HG12" dyana_name="HG11"/>
    <atom iupac_name="HG12" cns_name="HG11" dyana_name="HG12"/>
    <atom iupac_name="HG13" cns_name="HG13" dyana_name="HG13"/>
    <atom iupac_name="HG21" cns_name="HG22" dyana_name="HG21"/>
    <atom iupac_name="HG22" cns_name="HG21" dyana_name="HG22"/>
    <atom iupac_name="HG23" cns_name="HG23" dyana_name="HG23"/>
    <atom iupac_name="HT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="N" cns_name="N" dyana_name="N"/>
    <atom iupac_name="NT" cns_name="None" dyana_name="None"/>
    <atom iupac_name="O" cns_name="O" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O'" cns_name="OT1" dyana_name="O"/>
    <atom iupac_name="O''" cns_name="OT2" dyana_name="OXT"/>
  </residue>
  <residue residue_type="RNA_BASE" iupac_name="ADE" cns_name="ADE" dyana_name="ADE">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="C8" cns_name="C8" dyana_name="C8"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="H2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H61" cns_name="H61" dyana_name="H61"/>
    <atom iupac_name="H62" cns_name="H62" dyana_name="H62"/>
    <atom iupac_name="H8" cns_name="H8" dyana_name="H8"/>
    <atom iupac_name="HO2'" cns_name="HO2'" dyana_name="HO2'"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N6" cns_name="N6" dyana_name="N6"/>
    <atom iupac_name="N7" cns_name="N7" dyana_name="N7"/>
    <atom iupac_name="N9" cns_name="N9" dyana_name="N9"/>
    <atom iupac_name="O2'" cns_name="O2'" dyana_name="O2'"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="RNA_BASE" iupac_name="CYT" cns_name="CYT" dyana_name="CYT">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H41" cns_name="H41" dyana_name="H41"/>
    <atom iupac_name="H42" cns_name="H42" dyana_name="H42"/>
    <atom iupac_name="H5" cns_name="H5" dyana_name="H5"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H6" cns_name="H6" dyana_name="H6"/>
    <atom iupac_name="HO2'" cns_name="HO2'" dyana_name="HO2'"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N4" cns_name="N4" dyana_name="N4"/>
    <atom iupac_name="O2" cns_name="O2" dyana_name="O2"/>
    <atom iupac_name="O2'" cns_name="O2'" dyana_name="O2'"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="RNA_BASE" iupac_name="GUA" cns_name="GUA" dyana_name="GUA">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="C8" cns_name="C8" dyana_name="C8"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="H1" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H21" cns_name="H22" dyana_name="H21"/>
    <atom iupac_name="H22" cns_name="H21" dyana_name="H22"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H8" cns_name="H8" dyana_name="H8"/>
    <atom iupac_name="HO2'" cns_name="HO2'" dyana_name="HO2'"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N2" cns_name="N2" dyana_name="N2"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N7" cns_name="N7" dyana_name="N7"/>
    <atom iupac_name="N9" cns_name="N9" dyana_name="N9"/>
    <atom iupac_name="O2'" cns_name="O2'" dyana_name="O2'"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="O6" cns_name="O6" dyana_name="O6"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="RNA_BASE" iupac_name="URA" cns_name="URI" dyana_name="URI">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="H3" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5" cns_name="H5" dyana_name="H5"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H6" cns_name="H6" dyana_name="H6"/>
    <atom iupac_name="HO2'" cns_name="HO2'" dyana_name="HO2'"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="O2" cns_name="O2" dyana_name="O2"/>
    <atom iupac_name="O2'" cns_name="O2'" dyana_name="O2'"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4" cns_name="O4" dyana_name="O4"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="DNA_BASE" iupac_name="ADE" cns_name="ADE" dyana_name="ADE">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="C8" cns_name="C8" dyana_name="C8"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2" cns_name="H2" dyana_name="H2"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H2''" cns_name="H2''" dyana_name="H2''"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H61" cns_name="H61" dyana_name="H61"/>
    <atom iupac_name="H62" cns_name="H62" dyana_name="H62"/>
    <atom iupac_name="H8" cns_name="H8" dyana_name="H8"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N6" cns_name="N6" dyana_name="N6"/>
    <atom iupac_name="N7" cns_name="N7" dyana_name="N7"/>
    <atom iupac_name="N9" cns_name="N9" dyana_name="N9"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="DNA_BASE" iupac_name="CYT" cns_name="CYT" dyana_name="CYT">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H2''" cns_name="H2''" dyana_name="H2''"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H41" cns_name="H41" dyana_name="H41"/>
    <atom iupac_name="H42" cns_name="H42" dyana_name="H42"/>
    <atom iupac_name="H5" cns_name="H5" dyana_name="H5"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H6" cns_name="H6" dyana_name="H6"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N4" cns_name="N4" dyana_name="N4"/>
    <atom iupac_name="O2" cns_name="O2" dyana_name="O2"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="DNA_BASE" iupac_name="GUA" cns_name="GUA" dyana_name="GUA">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="C8" cns_name="C8" dyana_name="C8"/>
    <atom iupac_name="H1" cns_name="H1" dyana_name="H1"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H2''" cns_name="H2''" dyana_name="H2''"/>
    <atom iupac_name="H21" cns_name="H22" dyana_name="H21"/>
    <atom iupac_name="H22" cns_name="H21" dyana_name="H22"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H8" cns_name="H8" dyana_name="H8"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N2" cns_name="N2" dyana_name="N2"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="N7" cns_name="N7" dyana_name="N7"/>
    <atom iupac_name="N9" cns_name="N9" dyana_name="N9"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="O6" cns_name="O6" dyana_name="O6"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
  <residue residue_type="DNA_BASE" iupac_name="THY" cns_name="THY" dyana_name="THY">
    <atom iupac_name="C1'" cns_name="C1'" dyana_name="C1'"/>
    <atom iupac_name="C2" cns_name="C2" dyana_name="C2"/>
    <atom iupac_name="C2'" cns_name="C2'" dyana_name="C2'"/>
    <atom iupac_name="C3'" cns_name="C3'" dyana_name="C3'"/>
    <atom iupac_name="C4" cns_name="C4" dyana_name="C4"/>
    <atom iupac_name="C4'" cns_name="C4'" dyana_name="C4'"/>
    <atom iupac_name="C5" cns_name="C5" dyana_name="C5"/>
    <atom iupac_name="C5'" cns_name="C5'" dyana_name="C5'"/>
    <atom iupac_name="C6" cns_name="C6" dyana_name="C6"/>
    <atom iupac_name="C7" cns_name="C7" dyana_name="C7"/>
    <atom iupac_name="H1'" cns_name="H1'" dyana_name="H1'"/>
    <atom iupac_name="H2'" cns_name="H2'" dyana_name="H2'"/>
    <atom iupac_name="H2''" cns_name="H2''" dyana_name="H2''"/>
    <atom iupac_name="H3" cns_name="H3" dyana_name="H3"/>
    <atom iupac_name="H3'" cns_name="H3'" dyana_name="H3'"/>
    <atom iupac_name="H4'" cns_name="H4'" dyana_name="H4'"/>
    <atom iupac_name="H5'" cns_name="H5'" dyana_name="H5'"/>
    <atom iupac_name="H5''" cns_name="H5''" dyana_name="H5''"/>
    <atom iupac_name="H6" cns_name="H6" dyana_name="H6"/>
    <atom iupac_name="H71" cns_name="H71" dyana_name="H71"/>
    <atom iupac_name="H72" cns_name="H72" dyana_name="H72"/>
    <atom iupac_name="H73" cns_name="H73" dyana_name="H73"/>
    <atom iupac_name="HO3'" cns_name="H3T" dyana_name="HO3'"/>
    <atom iupac_name="HO5'" cns_name="H5T" dyana_name="HO5'"/>
    <atom iupac_name="N1" cns_name="N1" dyana_name="N1"/>
    <atom iupac_name="N3" cns_name="N3" dyana_name="N3"/>
    <atom iupac_name="O2" cns_name="O2" dyana_name="O2"/>
    <atom iupac_name="O3'" cns_name="O3'" dyana_name="O3'"/>
    <atom iupac_name="O4" cns_name="O4" dyana_name="O4"/>
    <atom iupac_name="O4'" cns_name="O4'" dyana_name="O4'"/>
    <atom iupac_name="O5'" cns_name="O5'" dyana_name="O5'"/>
    <atom iupac_name="OP1" cns_name="O1P" dyana_name="OP1"/>
    <atom iupac_name="OP2" cns_name="O2P" dyana_name="OP2"/>
    <atom iupac_name="P" cns_name="P" dyana_name="P"/>
  </residue>
</conversion_table>
« October 2017 »
October
MonTueWedThuFriSatSun
1
2345678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
3031